A FISENGE é constituída por doze Sindicatos de Engenheiros de onze estados brasileiros, com sede na cidade do Rio de Janeiro e diretoria com mandatos de três anos, eleitos nos Congressos Nacionais de Sindicatos de Engenheiros – CONSENGE. Tem um Conselho Deliberativo integrado pela Diretoria Executiva e por um representante de cada Sindicato filiado, que se reúne três vezes por ano. A Diretoria Executiva, composta por oito membros, se reúne ordinariamente seis vezes por ano.